中图分类：S831

学科分类：230.20

成果类别：基础理论

成果水平：未评价

研究起止时间：2011-01～2012-12

评价形式：验收

海南文昌鸡是具有400余年历史的海南优质鸡种,是我国家禽品种资源基因库中的宝贵财富。上世纪80年代受外来鸡种冲击,文昌鸡一度濒临绝迹,2006年海南文昌鸡通过国家家禽生产性能测试站测定,被农业部正式认定为国家级畜禽遗传资源保护品种,成为国内唯一被国家家禽品种审定委员会认定的地方鸡种。但是,目前对文昌鸡的起源和种内遗传多样性的研究,仅以少量个体作为代表做了初步研究。 本研究采用遗传学方法系统分析分布于海南岛不同地区的代表性文昌鸡群体的线粒体DNA（mtDNA）遗传多样性,并结合中国其它地方鸡种及原鸡数据,旨在 （1）从遗传学的角度回答文昌鸡的起源问题; （2）揭示文昌鸡群体的遗传多样性与群体间的遗传分化,为文昌鸡的遗传资源保护和利用提供遗传学证据,同时为文昌鸡的品种改良和育种工作提供技术支持。 运用PCR 产物直接测序的方法对海南省文昌市90 只文昌鸡样品的线粒体DNA 控制区（mtDNA D-loop）第Ⅰ高变区序列进行了分析。用CLUSTAL X 1.81 软件进行序列比较,其中38 只个体共检测到27 个核苷酸多态位点,全部为转换无颠换,序列突变率为5.29％。用DnaSP 软件估计出序列存在16 个单倍型,单倍型多样度（Hd）为0.935,核苷酸多样度（π）为0.01479,平均核苷酸差异数（k）为7.541。运用Mega 4.0 软件计算出不同个体间的遗传距离,并据此构建了NJ 系统树。文昌鸡样品在NJ 无根树上聚为4 大分支。研究结果表明,文昌鸡群体内个体序列变异程度较大,遗传多样性丰富,揭示文昌鸡在遗传组成上具有4 个母系来源。 本研究结果表明,目前文昌鸡mtDNA D-loop 序列存在丰富的多样性, 从母系遗传的角度揭示了文昌鸡群体资源相当丰富, 这为人们深入研究文昌鸡的种群遗传结构,有效地利用和保护文昌鸡种质资源,同时为建立保护群进行复种和提纯提供了遗传理论基础。