一、基本信息
性别：男
出生年月：1968年6月
民族：白族
学位：博士
职称：二级教授
研究方向：热带、南亚热带生物种质资源与基因组学，进化基因组学，保护基因组学，生物信息学与大数据挖掘
博士研究生招生方向：作物学，作物遗传育种，农业生物技术
硕士研究生招生方向：作物学，农艺与种业，农业资源利用
二、通讯地址
海南省海口市美兰区人民大道58号，海南大学亚太热带生物多样性与基因组学研究中心，邮编570228
三、联系方式
E-mail:Lgaogenomics@163.com；L.Rice.Gao@gmail.com
四、教育经历
1994.08至1997.07:在中国科学院植物研究所洪德元院士指导下获得植物学理学博士学位，从事中国野生稻的群体遗传学、分子生态学和保护生物学研究
1991.08至1994.07:在云南大学生物系植物学专业胡志浩教授指导下获得理学硕士学位，从事禾本科植物的分类、系统与进化研究
1987.09至1991.07:在云南大学生物系植物学专业获得理学学士学位
五、主要科研工作和留学经历
2021.11-现在:海南大学博士生／硕士生导师，二级教授，亚太热带生物多样性与基因组学研究中心主任
2016.11-2021.11:华南农业大学博士生／硕士生导师，二级教授，基因组学与生物信息学研究中心主任
2018.3-至今:湖南农业大学“神农学者”特聘教授
2015.5-2020.5:华中农业大学园艺学院，特聘教授
2015.6-2020.8:中国科学院昆明植物研究所博士生／硕士生导师；中国科学院特聘研究员；中国科学院大学教授；中国科学院昆明植物研究所“一三五”植物种质资源与基因组学研究群组群长
2014.1-2019.1:云南省热带作物科学研究所橡胶工程中心首席研究员，热带作物种质资源与基因组学重点实验室主任
2012.1-2016.12:昆明理工大学生命科学与技术学院、信息与自动化学院特聘教授，博士生／硕士生导师
2011.7-9：美国佐治亚大学遗传学系Visiting Faculty，合作教授为Jeffrey Lynn Bennetzen院士
2006.6-2014.12:中国科学院昆明植物研究所博士生／硕士生导师，研究员；任国家大科学装置中国西南野生生物种质资源库副主任；植物种质资源与基因组学研究中心主任。
2006.05至2007.05:在美国德克萨斯大学奥斯丁分校分子细胞与发育生物学系任Research Assistant Professor，致力于植物异源多倍体形成后基因表达模式与进化机制的比较功能基因组学研究。
2005.01至2006.04:在美国休斯顿大学生物与生物化学系任Research Assistant Professor,与国际著名的分子进化生物学家Dan Graur教授在分子进化和生物信息学等领域开展合作，致力于LTR-反转座子对植物基因组大小进化和基因表达与分化的影响研究。
2003.07至2004.12:在美国德克萨斯大学休斯顿分校的人类遗传学中心任Research Fellow,合作导师为Hideki Innan教授。在群体基因组学和比较基因组学等国际前沿学科在理论上得到了系统的学习和训练，致力于基因重复的分子进化以及水稻的驯化与人工选择的理论群体遗传学研究。
2002.07至2003.06:在美国密西根大学(Ann Arbor)生态与进化生物学系任Research Fellow,合作导师为张建之教授，在分子进化、生物信息学和进化基因组学等国际前沿学科理论上得到了系统的学习和训练，致力于年轻重复基因的分子进化、群体遗传学和比较基因组学研究。
2000.11至2002.06:在美国佐治亚大学遗传学系Susan Wessler院士和John F. McDonald教授指导下作博士后研究，在分子进化、生物信息学和基因组学等前沿学科领域上接受了系统的学习和训练，致力于水稻基因组LTR-反转座子的进化研究。
1999.11至2000.11:被遴选为联合国粮农组织下属的国际植物遗传资源研究所的Vavilov-Frankel Fellow，赴美国华盛顿大学(圣路易斯)生物学系在Barbara A. Schaal院士指导下作博士后研究。在此期间系统地学习和加强了群体遗传学、谱系地理学、分子系统学和保护遗传学的基础理论，致力于普通野生稻的群体遗传结构与原生境保护研究。
1999.10至2000.11:任中国农业科学院作物品种资源研究所稻种资源研究室副研究员，主要从事我国野生稻种资源的研究、保护与利用。
1998.08至1998.09:在国际水稻研究所（IRRI）作访问科学家，进行全球稻种资源保护和基因库管理训练以及稻属植物的分类学研究。
1997.08至1999.09:在中国农业科学院作物品种资源研究所农业农村部作物种质资源与生物技术重点实验室董玉琛院士指导下作博士后研究。在此期间系统地学习了植物种质资源学的基础理论和分子标记育种技术，开展了我国稻种资源基于水稻遗传图谱的遗传多样性研究，致力于亚洲栽培稻的起源与驯化、野生稻的分子生态学和保护遗传学研究。
1994.08至1997.07:在中国科学院植物研究所攻读博士学位期间，致力于中国三种野生稻（普通野生稻、药用野生稻和颗粒野生稻）的群体遗传学和保护生物学研究。
1991.08至1994.07:在云南大学生物系攻读硕士学位期间，开展禾本科（野古草族和虎尾草属）的分类学与细胞遗传学研究；参与并完成了云南大学生态研究所牵头组织的云南金沙江向家坝水电站、丽江玉龙雪山和抚仙湖库周区的植被生态学调查和环境影响评价。
六、主要获奖情况或荣誉
1997年和1999年两次获得瑞典国际科学基金会(IFS)荣誉研究基金。该基金会仅资助全球发展中国家三十岁以下年轻优秀的科学家
1999年获得联合国粮农组织下属的国际植物遗传资源研究所(BiodiversityInternational)（原名为IPGRI）授予的Vavilov-Frankel Fellow。该奖项从全世界约1000余名申请人中，每年仅授予两名年轻优秀的科学家
2008年获得“引进国外杰出人才”的择优支持
2008年入选云南省首届引进高端科技人才并获得云南省高层次科技人才培引工程专项人才基金的支持
2009年入选人力资源社会保障部、科技部、教育部、财政部、国家发改委、国家自然科学基金委、中国科协等七部委联合设立的“新世纪百千万人才工程”国家级人选
2011年入选云南省委首批“百名海外高层次人才引进计划”
2011年入选云南省委联系专家
2011年获得何梁何利科学技术青年创新奖
2012年享受国务院政府特殊津贴
2013年入选科技部推进计划中青年科技创新领军人才
2014年领衔入选“热带作物种质资源与基因组学”云南省创新团队
2015年批准依托云南文山苗乡三七实业有限公司建立云南省委基层专家工作站
2016年入选第三批中共中央组织部“万人计划”（“特支计划”）科技创新领军人才
2016年入选“科学中国人”年度人物
2017年入选国际茶叶组织“世界茶人奖”
2017年入选“云岭英才计划”的“云岭高层次人才”
七、主持和参加的重要科研项目：
迄今共主持或参加中国科技部“973”项目、重点研发计划、国家自然科学基金会（NSFC）、中国科学院、瑞典国际科学基金会（IFS）、联合国粮农组织、美国自然科学基金会（NSF）、美国国家卫生研究院（NIH）、农业农村部、中国科学院和云南省等国际、国家和省部级科研项目30多个。
（一）主持的项目：
（1）瑞典国际科学基金会（C/2738-1,2）：中国野生稻的收集、调查和遗传多样性与保护生物学研究（1997.8-2002.12），2.4万美元，已顺利结题。
（2）联合国粮农组织国际植物遗传资源研究所（IPGRI）：利用SSR评价中国普通野生稻的群体遗传结构及其原生境保护的研究（1999.5-2002.5），1.5万美元，已顺利结题。
（3）国家自然科学基金(30025005)：颗粒野生稻的群体遗传结构和濒危机制的研究（1998.1-2001.12），12.5万，已顺利结题。
（4）中国博士后管理委员会项目：亚洲栽培稻及其野生近缘植物基于遗传图谱的遗传多样性研究（1997.8-1999.9），4万，已顺利结题。
（5）中国科学院“九五”重大项目(KZ951-B1-102)：中国药用野生稻的遗传多样性和保护生物学研究（“中国重要珍稀濒危植物的保护生物学研究”子专题，1998.6-2002.12），4万，项目主持人为洪德元院士和葛颂研究员，本人为子课题主持人,已顺利结题。
（6）中国科学院知识创新工程方向性重点项目(KSCX2-YW-N-029)：重要野生禾本科植物的比较基因组学和重要功能基因的研究(2007.1-2009.12)，130万，已顺利结题。
（7）科技部“973 ”项目(2007CB815701)：重要栽培植物的人工选择与基因组进化（2007.1-2012.12），60万，子专题负责人，已顺利结题。
（8）中国科学院昆明植物研究所引进人才启动项目（51O602511121）：栽培稻及野生近缘植物的进化与比较功能基因组学研究（2007.1-2010.12），73万，已顺利结题。
（9）中国科学院昆明植物研究所创新三期领域前沿重点项目（672705232515）：云南大叶茶的种质资源与基因组学的初步研究（2008.1-2012.12），80万，已顺利结题。
（10）云南省自然科学基金重点项目（2008CC016）：云南大叶茶的起源及其重要品质相关基因的比较功能基因组学研究（2009.1-2011.12），45万，已顺利结题。
（11）中国科学院择优支持项目：云南大叶茶、云南山茶花和油茶的比较功能基因组学与种质资源的初步研究（2009.1-2011.12），200万，已顺利结题。
（12）云南省高端科技人才引进项目（20080A009）：云南大叶茶重要品质相关基因的比较功能基因组学研究（2009.1-2011.12），300万，已顺利结题。
（13）国家自然科学基金NSFC-云南联合基金项目（U0936603）：油茶、云南大叶茶和云南山茶种质资源的保护和比较功能基因组学研究”（2010.1-2013.12）,185万，已顺利结题。
（14）云南省自然科学基金重点项目：云南普通野生稻种质资源和基因组学的初步研究（2011.1-2013.12），40万，已顺利结题。
（15）云南省农业创新行动计划：云南大叶茶种质资源保护和基因组学研究（2011.1-2015.12），180万，已顺利结题。
（16）云南省农业创新行动计划：橡胶树种质资源保护和基因组学研究（2014.1-2016.12），500万，已顺利结题。
（17）国家“万人计划科技创新领军人才”项目，2017-2019，100万，已顺利结题。
（18）国家自然科学基金NSFC-云南省联合基金项目（U1902205）：基于代谢组学与全基因组关联分析解析云南三七重要农艺性状与代谢化合物及其优异种质资源的发掘利用，2020/01/01-2023/12/31，228万，执行中。
（二）参加的主要研究项目：
（1）中国科学院分类与区系特别资助费项目：稻属的分子系统学与进化研究（1994-1997），10.5万，项目主持人为洪德元，已顺利结题。
（2）中国科学院院长基金：中国稻属的进化植物学和保护生物学研究（1994-1997），10万，项目主持人为洪德元，已顺利结题。
（3）国家“973”重大项目子专题：中国稻种资源核心种质的研究与构建（1998-2002），150万，主持人为李自超等，已顺利结题。
（4）农业农村部“95”科技攻关项目：野生稻(Oryza longistaminataandO. rufipogon)中抗稻瘟病和白叶枯病优异基因的导入与水稻的分子标记育种（1997-2000），60万，主持人为刘旭和庞汉华，已顺利结题。
（5）美国国家自然科学基金植物基因组项目：植物转座子和水稻基因组进化（2000-2005），120万美元，主持人为Susan Wessler，已顺利结题。
（6）美国国立卫生研究所项目：年轻重复基因的功能分化进化机制的研究（2002-2007），100万美元，主持人为Jian-zhi Zhang，已顺利结题。
（7）美国德克萨斯大学休斯敦分校启动基金：利用人和啤酒酵母及其近缘物种基因组数据进行群体遗传学研究（2003-2006），30万美元，主持人为Hideki Innan，已顺利结题。
（8）美国休斯敦大学特聘教授启动基金：利用模式生物基因组信息进行分子进化和生物信息学研究（2004-2007），40万美元，主持人为Dan Graur，已顺利结题。
（9）美国国家自然科学基金植物基因组项目：植物多倍化的比较功能基因组学基础（2005-2010），300万美元，主持人为Jeff Chen，参加人之一，已顺利结题。
（10）中国科学院知识创新工程方向性重点项目：高山流石滩植物适应冷热胁迫快速交替的机制研究（2007-2009），100万，主持人为李唯奇，参加人之一，已顺利结题。
八、论文发表（*为通讯联系人）
在Nature（1），Science（2），PNAS（2）,Molecular Plant（5）,Trends in Genetics，Genome Biology,Plant Physiology,PLoS Genetics，Genetics，Molecular Ecology(2)，Theoretical and Applied Genetics（2）等刊物上发表论文121篇，迄今引用4,000多次。
123Dai S-f, Zhu X-g, Hutang G-r, Li J-y, Tian J-q, Jiang X-h, Zhang D,Li-zhi Gao*.2022. Genome Size Variation and Evolution Driven by Transposable Elements in the GenusOryza.Front. Plant Sci.13:921937. doi: 10.3389/fpls.2022.921937
122Jing Zhang, Yan Wang, Tao Chen, Qing Chen, Lei Wang, Zhen-shan Liu, Hao Wang, Rui Xie, Wen He, Ming Li, Cong-li Liu, Shao-feng Yang,Meng-yao Li, Yuan-xiu Lin, Yun-ting Zhang, Yong Zhang, Ya Luo, Hao-ru Tang,Li-zhi Gao*,Xiao-rong Wang*. 2021. Evolution of Rosaceae Plastomes Highlights Unique Cerasus Diversification and Independent Origins of Fruiting Cherry.Frontiers in Plant Science.DOI: 10.3389/fpls.2021.736053
121Xin Peng, Win Tun, Shuang-feng Dai, Jia-yue Li, Qun-jie Zhang, Guo-ying Yin,Jinmi Yoon, Lae-hyeon Cho, Gynheung An,Li-zhi Gao*.2021. Genome-Wide Analysis of CCT Transcript Factors to Identify Genes Contributing to Photoperiodic Flowering inOryza rufipogon.Frontiers in Plant ScienceDOI: 10.3389/fpls.2021.736419
120Li-Ying Feng,Li-Zhi Gao*.2021. Characterization of chloroplast genome ofEleusine coracana, a highly adaptable cereal crop with high nutritional reputation.Mitochondrial DNA Part B6(10):2816-2818
119Li-Ying Feng,Chao Shi,Li-Zhi Gao*.2021. The complete chloroplast genome sequence ofBromus catharticusVahl. (Poaceae).Mitochondrial DNA Part B6(10):2825-2827
118Li-Ying Feng,Chao Shi,Li-Zhi Gao*.2021. The complete chloroplast genome sequence ofArundo formosanaHack. (Poaceae).Mitochondrial DNA Part B6(10):2819-2821
117Li-Ying Feng,Li-zhi Gao*. 2021. Characterization of the chloroplast genome sequence ofBonia amplexicaulis(L.C.Chia, H.L.Fung & Y.L.Yang) N.H.Xia (Poaceae).Mitochondrial DNA Part B6 (10):2822-2824.
DOI:
116Kui Li, Wenkai Jiang, Yuanyuan Hui, Mengjuan Kong,Li-zhi Gao*，Pengfu Li,*, Shan Lu*. 2021. Gapless indica rice genome reveals synergistic effects of active transposable elements and segmental duplications that promote rice genome evolution.Molecular Plant14 (10): 1745-1756 DOI: 10.1101/2020.12.24.424264
115Hong Nan, Yanglei Lin, Xinghua Wang,Li-zhi Gao*.2021. Comprehensive Genomic Analysis and Expression Profiling of Cysteine-Rich Polycomb-Like Transcription Factor Gene Family in Tea Tree.Horticultural Plant Journal7 (Suppl 13) DOI: 10.1016/j.hpj.2021.03.001
114Wei Li, Cong Shi, Kui Li, Qunjie Zhang, Yan Tong, Yun Zhang, Jun Wang, Lynn Clark,Li-zhi Gao*. 2021. Draft genome of the herbaceous bambooRaddia distichophylla.G3: Genes|Genomes|Genetics11(2) DOI: 10.1093/g3journal/jkaa049
113Wei Li,Xun-Ge Zhu,Qun-Jie Zhang,Kui Li,Dan Zhang,Cong Shi,Li-Zhi Gao*. 2020.SMRT sequencing generates the chromosome-scale reference genome of tropical fruit mango,Mangifera indica.bioRxivdoi:https://doi.org/10.1101/2020.02.22.960880
112Nan, H., Lin, YL., Liu, J., Huang H.,Li-zhi Gao*. 2020. Genome-wide analysis of the WRKY transcription factor gene family and their response to salt stress in rubber tree.Tropical Plant Biol.https://doi.org/10.1007/s12042-020-09268-x
111Zhang D, Li W, Chen ZJ, Wei FG, Liu YL,Li-zhi Gao*. 2020. SMRT- and Illumina-based RNA-seq analyses unveil the ginsinoside biosynthesis and transcriptomic complexity inPanax notoginseng.Sci Rep.2020 Sep 17;10(1):15310. doi: 10.1038/s41598-020-72291-1
110Wei Li, Fen Zhang,Li-zhi Gao*. 2020.SMRT-based mitochondrial genome of the edible mushroomMorchella conica.Mitochondrial DNA Part B5(3):3219-3220
109Li-Ying Feng, Jin Liu, Cheng-Wen Gao, Hai-Bo Wu, Guo-Hua Li andLi-Zhi Gao.2020. Higher genomic variation in wild than cultivated rubber trees,Hevea brasiliensis, revealed by comparative analyses of chloroplast genomes.Front. Ecol. Evol.|https://doi.org/10.3389/fevo.2020.00237
108Wei Li, Qun-jie Zhang, Ting Zhu, Yan Tong, Kui Li, Cong Shi, Yun Zhang, Yun-long Liu, Jian-jun Jiang, Yuan Liu, En-hua Xia, Hui Huang, Li-ping Zhang, Dan Zhang, Chao Shi, Wen-kai Jiang, You-jie Zhao, Shu-yan Mao, Jun-ying Jiao, Ping-zhen Xu, Li-li Yang,Li-zhi Gao*.2020. Draft genomes of two outcrossing wild rice,Oryza rufipogonandO. longistaminata, reveal genomic features associated with mating-system evolution.Plant Direct.DOI: 10.1002/pld3.232
107Cong Shi, Wei Li, Qun-Jie Zhang, Yun Zhang, Yan Tong, Kui Li, Yun-Long Liu,Li-zhi Gao*. 2020. The draft genome sequence of an upland wild rice species,Oryza granulata.Scientific Data, 7:131
106Yan Tong,Li-zhi Gao*. 2020.Development and characterization of EST-SSR markers forCamellia reticulata:Camellia reticulatamicrosatellitesApplications in Plant Sciences8(4): e11348
105Wei Li, Kui Li, Ying Huang, Cong Shi, Wu-Shu Hu, Yun Zhang, Qun-Jie Zhang, En-Hua Xia, Ge-Ran Hutang, Xun-Ge Zhu, Yun-Long Liu, Yuan Liu, Yan Tong, Ting Zhu, Hui Huang, Dan Zhang, Yuan Zhao, Wen-Kai Jiang, Jie Yuan, Yong-Chao Niu, Cheng-Wen Gao,Li-zhi Gao*. 2020. SMRT sequencing of theOryza rufipogongenome reveals the genomic basis of rice adaptation.Communications Biology, 3:167
104Qun-Jie Zhang, Wei Li, Kui Li, Hong Nan, Cong Shi, Yun Zhang, Zhang-Yan Dai, Yang-Lei Lin, Xiao-Lan Yang, Yan Tong, Dan Zhang, Cui Lu, Li-Ying Feng, ChenFeng Wang, Xiao-Xin Liu, Jian-An Huang, Wen-Kai Jiang, Xing-Hua Wang, XingCai Zhang, Evan E. Eichler, Zhong-Hua Liu,Li-zhi Gao*. 2020. The Chromosome-Level Reference Genome of Tea Tree Unveils Recent Bursts of Non-autonomous LTR Retrotransposons to Drive Genome Size Evolution.Molecular Plant. DOI: 10.1016/j.molp.2020.04.009（首次发表的达到染色体水平的小叶茶茶树基因组，发表后被国内外几乎所有重要媒体报道）
103Hong Nan, Wei L, Yang-lei Lin,Li-zhi Gao*. 2020. Genome-Wide Analysis of WRKY Genes and Their Response to Salt Stress in the Wild Progenitor of Asian Cultivated Rice,Oryza rufipogon.Frontiers in Genetics, 11:359
102Jin Liu, Cong Shi, Cheng-Cheng Shi, Wei Li, Qun-Jie Zhang, Yun Zhang, Kui Li, Hui-Fang Lu, Chao Shi, Si-Tao Zhu, Zai-Yun Xiao, Hong Nan, Yao Yue, Xun-Ge Zhu, Yu Wu, Xiao-Ning Hong, Guang-Yi Fan, Yan Tong, Dan Zhang, Chang-Li Mao, Yun-Long Liu, Shi-Jie Hao, Wei-Qing Liu, Mei-Qi Lv, Hai-Bin Zhang, Yuan Liu, Ge-Ran Hu-tang, Jin-Peng Wang, Jia-Hao Wang, Ying-Huai Sun, Shu-Bang Ni, Wen-Bin Chen, Xing-Cai Zhang, Yuan-Nian Jiao, Evan E. Eichler, Guo-Hua Li, Xin Liu,Li-Zhi Gao*. 2020. The Chromosome-Based Rubber Tree Genome Provides New Insights into Spurge Genome Evolution and Rubber Biosynthesis.Molecular Plant, 13(2): 336-350（首次发表的达到染色体水平的橡胶树基因组，发表后被国内外几乎所有重要媒体报道）
101Wei Li, Kui Li, Qun-jie Zhang, Ting Zhu, Yun Zhang, Cong Shi, Yun-long Liu, En-hua Xia, Jian-jun Jiang, Chao Shi, Li-ping Zhang, Hui Huang, Yan Tong, Yuan Liu, Dan Zhang, Yuan Zhao, Wen-kai Jiang, You-jie Zhao, Shu-yan Mao, Jun-ying Jiao, Ping-zhen Xu, Li-li Yang, Guo-ying Yin,Li-zhi Gao. 2020. Improved hybriddenovogenome assembly and annotation of African wild rice,Oryza longistaminata, from Illumina and PacBio sequencing reads.ThePlant Genome, e20001
100Fen Zhang, Wei Li, Cheng-wen Gao, Dan Zhang,Li-zhi Gao*. 2019.. Deciphering tea tree chloroplast and mitochondrial genomes ofCamellia sinensisvar.assamica.Scientific Data, 6:209
99 Li-Zhi Gao*, Yun-Long Liu, Dan Zhang, Wei Li, Ju Gao, Yuan Liu, Kui Li, Chao Shi, Yuan Zhao, You-Jie Zhao, Jun-Ying Jiao, Shu-Yan Mao, Cheng-Wen Gao, Evan E. Eichler. 2019. Evolution ofOryzachloroplast genomes promoted adaptation to diverse ecological habitats.Communications Biology, 3:278
98Hong Nan,Gao L. Z.*.2019. Genome-wide analysis ofWRKYgenes and their response to hormone and mechanic stresses in carrot.Frontiers in Genetics10:363. doi: 10.3389/fgene.2019.00363
97You-jun Huang, …,Gao L. Z., Jian-qin Huang.2019.The genomes of pecan and Chinese hickory provide insights intoCaryaevolution and nut nutrition.GigaScience8(5)
96Zhong-hua Liu,Gao L. Z., Zong-mao Chen, Xiao-xiong Zeng, Jian-an Huang, Yu-shun Gong, Qin Li, Shuo-qian Liu, Yong Lin, Shu-xian C ai, Sheng Zhang, Li-gui Xiong, Wei Li, Li Zhou, Xinru Wang, Feng-jian Luo, Qun-jie Zhang, Dan Zhang. 2019. Leading progress on genomics, health benefits and utilization of tea resources in China.Nature556(7742).https://www.nature.com/articles/d42473-019-00032-8（与刘仲华院士和陈宗懋院士共同在Nature上组织了茶叶专刊，受到国内外的高度关注）
95Hui Huang, Qiuyang Yao, Enhua Xia, andGao L. Z.*.2018. Metabolomics and transcriptomics analyses reveal nitrogen
influences on the accumulation of flavonoids and amino acids in young shoots of tea plant (Camellia sinensisL.) associated with tea flavor.J. Agric. Food Chem.66, 9828−9838
94Junki Lee, Nomar Espinosa Waminal, Hong-Il Choi, Sampath Perumal, Sang-Choon Lee, Van Binh Nguyen, Woojong Jang, Nam-Hoon Kim,Gao L. Z., and Tae-Jin Yang. 2017. Rapid amplification of four retrotransposon families promoted speciation and genome size expansion in the genusPanax.Scientific Reports7(1). DOI: 10.1038/s41598-017-08194-5
93Hui Huang, En-Hua Xia, Hai-Bin Zhang, Qiu-Yang Yao,Gao L. Z.*. 2017.De novotranscriptome sequencing ofCamellia sasanquaand the analysis of major candidate genes related to floral traits.Plant Physiology and Biochemistry120: 103-111
92Xi Du, Qi Zhao, En-Hua Xia,Gao L. Z., Franck Richard, Zhu L. Yang. 2017. Mixed-reproductive strategies, competitive mating-type distribution and life cycle of fourteen black morel species.Scientific Reports7: 1493 DOI:10.1038/s41598-017-01682-8
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87En-Hua Xia, Hai-Bin Zhang, Jun Sheng, Kui Li, Qun-Jie Zhang, Changhoon Kim, Yun Zhang, Yuan Liu, Ting Zhu, Wei Li, Hui Huang, Yan Tong, Hong Nan, Cong Shi, Chao Shi, Jian-Jun Jiang, Shu-Yan Mao, Jun-Ying Jiao, Dan Zhang, Yuan Zhao, You-Jie Zhao, Li-Ping Zhang, Ben-Ying Liu, Yue Yu, Sheng-Fu Shao, De-Jiang Ni, Evan E. Eichler,Gao L. Z.*. 2017. The tea tree genome provides insights into tea flavor and independent evolution of caffeine biosynthesis.Molecular Plant(http://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2017.04.002)（作为国际上首次破译的茶树基因组，发表后被CCTV（新闻联播）、CNN、BBC等几乎所有国内外重要的新闻媒体报刊的采访、报道或转载；该论文被中国科学技术协会遴选为“优秀期刊论文”；是ESI高被引论文）
86En-Hua Xia, Da-Rong Yang, Jian-Jun Jiang, Qun-Jie Zhang, Yuan Liu,Yun-Long Liu,Yun Zhang,Hai-Bin Zhang, Cong Shi, Yan Tong,Changhoon Kim, Hua Chen,Yan-Qiong Peng, Yue Yu, Wei Zhang,Evan E. Eichler,Gao L. Z.*. 2017.The caterpillar fungus,Ophiocordyceps sinensis, genome provides insights into highland adaptation of fungal pathogenicity.Scientific Reports7(1): 1806. doi: 10.1038/s41598-017-01869-z.
85Dan Zhang, Wei Li, En-hua Xia, Qun-jie Zhang, Yuan Liu, Yun Zhang, Yan Tong, Yuan Zhao, Yong-chao Niu, Jia-huan Xu,Gao L. Z.*. 2017. The medicinal herbPanax notoginsenggenome provides insights into ginsenoside biosynthesis and genome evolution.Molecular Plant10: 903–907（首次发表的人参属三七基因组，发表后被国内外几乎所有重要媒体报道）
84Fan-chun Zeng, You-Jie Zhao, Que-jie Zhang,Gao L. Z.*. 2017.LTRtype, an efficienttool topredictstructurally complex LTR retrotransposon elementsand nested insertions.Frontiers in Plant Science8:402. doi: 10.3389/fpls.2017.00402
83T Mornkham, PP Wangsomnuk, XC Mo, FO Francisco,Gao L. Z.,H Kurzweil. 2016.Development and characterization of novel EST-SSR markers and their application for genetic diversity analysis of Jerusalem artichoke (Helianthus tuberosusL.).Genetics and Molecular Research: GMRdoi: 10.4238/gmr15048857
82Huang J, Zhang C, Zhao X, Fei Z, Wan K, Zhang Xiaoming Pang, Yin X, Bai Y, Sun X,Gao L. Z., Li R, Zhang J, Li X. 2016. The jujube genome provides insights into genome evolution and the domestication of sweetness/acidity taste in fruit trees.PLoS Genetics12(12): e1006433. doi:10.1371/journal.pgen.1006433
81Qing-Xia Ding, Jia Liu ,Gao L. Z.*.2016. The complete chloroplast genome of eggplant (Solanum melongenaL.).Mitochondrial DNA Part B1:1, 843-844, DOI:
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80Cheng-wen Gao,Gao L. Z.*.2016. The complete chloroplast genome sequence of semi-wild soybean,Glycine gracilis(Fabales: Fabaceae).Conservation Genetics Resources(DOI: 10.1007/s12686-016-0683-z)
79Cheng-wen Gao,Gao L. Z.*.2016. The complete chloroplast genome sequence of wild soybean,Glycine soja(Fabales: Fabaceae).Conservation Genetics Resources(DOI 10.1007/s12686-016-0659-z)
78Dan Zhang, Yuan Liu,Gao L. Z.*.2016. The complete chloroplast genome sequence ofPhyllostachys heterocycla, a fast-growing non-timber bamboo (Poaceae: Bambusoideae).Conservation Genetics Resources(DOI: 10.1007/s12686-016-0654-4)
77Shuo Wang,Gao L. Z.*.2016. Complete chloroplast genome sequence and annotation of the tropicaljaponicagroup of Asian cultivated rice (Oryza sativaL.).Genome Announcement18;4(1). pii: e01703-15. doi: 10.1128/genomeA.01703-15
76 Gao L. Z.*, Dan Zhang, Kui Li, Ju Gao. 2016. The complete plastid genome sequence of the wild-riceZizania latifoliaand comparative chloroplast genomics of the tribe Oryzeae.Frontiers in Ecology and Evolution4:88.doi: 10.3389/fevo.2016.00088
75Chao Shi, Shuo Wang, En-Hua Xia, Jian-Jun Jiang, Fan-Chun Zeng, Qiu-Yang Yao, andGao L. Z.*.2016.Full transcription of thephotosynthetic eukaryote chloroplast genome.Scientific Reports6doi:10.1038/srep30135（2016-08-05的【CCTV13】（朝闻天下）以“中国科学院发现叶绿体基因全转录新机制”为题对该研究成果做了采访报道；发表后被国内外其它重要媒体报道）
74 Gao L. Z.*,Cheng-wen Gao. 2016.Lowereddiversityand increasedinbreeding depression withinperipheralpopulationsofan endangered wild riceOryza rufipogon.PLoS ONE11(3):e0150468. doi: 10.1371/journal.pone.0150468
73Qiu-Yang Yao, Hui Huang, Yan Tong,Gao L. Z.*.2016. Transcriptome sequencing reveals gene expression profiles of flavonoid and fatty acid biosynthesis pathways and the development of EST-SSR markers inCamellia reticulata(Theaceae).Frontiers in Plant Sciencedoi: 10.3389/fpls.2016.00163
72En-Hua Xia*, Qiu-Yang Yao*, Hai-Bin Zhang, Jian-Jun Jiang, Li-Ping Zhang,Gao L. Z.*.2016.CandiSSR: an efficient pipeline used for identifying candidate polymorphic SSRs based on multiple assembled sequences.Frontiers in Plant Science6:1171. doi: 10.3389/fpls.2015.01171
71Wang S, Shi C, Zhang YJ, Hu GX,Gao L. Z.*. 2016. Trading away ancient amber's secrets.Science351(6276):926. doi: 10.1126/science.351.6276.926-a.（发表后被国内外几乎所有重要媒体报道）
70Ning Wang,Gao L. Z.*2015.Genome-wide analysis of WRKY family of transcription factors in common bean,Phaseolus vulgaris: chromosomal localization, protein structure, evolution and expression divergence.Plant Gene5: 22–30
69Shuo Wang,Gao L. Z.*2015.Complete chloroplast genome sequence of green foxtail (Setaria viridis), a promising model system for C4photosynthesis.Mitochondrial DNA: 1-2.DOI:10.3109/19401736.2015.1079867
68Shuo Wang,Gao L. Z.*2015.Complete chloroplast genome sequence of an irreplaceable dietary and model crop, foxtail millet (Setaria italica).Mitochondrial DNA: 1-2.DOI: 10.3109/19401736.2015.1089562
67Shuo Wang, Cheng-wen Gao,Gao L. Z.*2015.Plastid genome sequence of an ornamental and editable fruit tree of Rosaceae,Prunus mume.Mitochondrial DNA: 1-2.DOI:10.3109/19401736.2015.1089546
66Jie Zhang, Xiang-dong Liu,Gao L. Z.*.2015. Methylome of autotetraploid rice revealed DNA methylation variation of transposable elements and their effects on gene expression.Proc Natl Acad Sci USA112(50):E7022–E7029（发表后被国内外几乎所有重要媒体报道）
65Zengjie Han, Wei Li, Yuan Liu,Gao L. Z.* 2015.The complete chloroplast genome of North American ginseng,Panax quinquefolius.Mitochondrial DNA: 1-2.DOI:10.3109/19401736.2015.1066365
64Dan Zhang, Wei Li, Chengwen Gao, Yuan Liu,Gao L. Z.*2015. The complete plastid genome sequence ofPanax notoginsengand comparative chloroplast genomics of the family Araliaceae.Mitochondrial DNA: 1-2.DOI:10.3109/19401736.2015.1063131
63Bang Liu,Gao L. Z.*2015.The complete chloroplast genome sequence ofCucumis sativusvar.Hardwickii, the wild progenitor of cultivated cucumber.Mitochondrial DNA: 1-2.DOI:10.3109/19401736.2015.1101588
62Jie Zhang, Dan Zhang, Chao Shi, Ju Gao,Gao L. Z.*.2015. The complete chloroplast genome sequence ofChikusichloa aquatica(Poaceae: Oryzeae).Mitochondrial DNA: 1-2.DOI:10.3109/19401736.2015.1053058
61Bang Liu, Xiao-di Hu,Gao L. Z.*2015.The complete mitochondrial genome of the central chimpanzee,Pan troglodytes troglodytes.Mitochondrial DNA: 1-2.DOI:10.3109/19401736.2015.1053060
60 Hai-Bin Zhang, En-Hua Xia, Hui-Huang, Jian-Jun Jiang, Ben-ying Liu and Gao L. Z.*. 2015. De novo transcriptome assembly of the wild relative of tea tree (Camellia taliensis) and comparative analysis with tea transcriptome identified putative genes associated with tea-quality and stress response. BMC Genomics 16:298 (DOI: 10.1186/s12864-015-1494-4)
59Qiu-yang Yao, En-hua Xia, Fei-hu Liu,Gao L. Z.*2015. Genome-wide identification and comparative analysis of expression profiling reveal a rapid expansion and functional divergence of duplicated genes of WRKY gene family in cabbage,Brassica oleraceavar.capitata.Gene557(1):35-42.
58Qun-jie Zhang, Qun-jie Zhang, Ting Zhu, En-hua Xia, Chao Shi, Yun-long Liu, Yun Zhang, Yuan Liu, Wen-kai Jiang, You-jie Zhao, Shu-yan Mao, Li-ping Zhang, Hui Huang, Jun-ying Jiao, Ping-zhen Xu, Qiu-yang Yao, Fan-chun Zeng, Li-li Yang, Ju Gao, Da-yun Tao, Yue-ju Wang, Jeffery L. Benntzen,Gao L. Z.*.2014. Rapid diversification of fiveOryzaAA genomes associated with rice adaptation.Proc Natl Acad Sci USA111(46)E4954-E4962(doi/10.1073/pnas.1418307111)（发表次日被国务院官网列为新闻要闻，被国内外几乎所有重要媒体报道）
57En-Hua Xia, Jian-Jun Jiang, Li-Ping Zhang, Hui Huang, Hai-Bin Zhang,Gao L. Z.* 2014. Transcriptome analysis of the oil-rich tea plant,Camellia oleifera, reveals candidate genes related to lipid metabolism.PLoS ONE9(8): e104150. doi:10.1371/journal.pone.0104150
56Ju Gao, Shuo Wang,Gao L. Z.*.2014. The complete chloroplast genome sequence ofPhyllostachys sulphurea(Poaceae: Bambusoideae).Mitochondrial DNA(doi: 10.3109/19401736.2014.926516)
55Ju Gao, Kui Li,Gao L. Z.*.2014.The complete chloroplast genome sequence ofBambusa multiplex(Poaceae:Bambusoideae).Mitochondrial DNA(doi:10.3109/19401736.2014.926515)
54Hui Huang, Chao Shi, Yuan Liu, Shu-yan Mao,Gao L. Z.*.2014. ThirteenCamelliachloroplast genome sequences determined by high-throughput sequencing:genome structure andphylogenetic relationships.BMC Evolutionary Biology14:151 doi:10.1186/1471-2148-14-151
53Qun-jie Zhang,Gao L.Z.*.2014. The complete chloroplast genome sequence of desert poplar (Populus euphratica).Mitochondrial DNA(DOI: 10.3109/19401736.2014.913159)
52Fan-chun Zeng, Cheng-wen Gao,Gao L.Z.*.2014. The complete chloroplast genome sequence of American bird pepper (Capsicum annuumvar.glabriusculum).Mitochondrial DNA(DOI: 10.3109/19401736.2014.913160)
51Xiao-di Hu, En-hua Xia,Gao L. Z.*2014. The complete mitochondrial genome of eastern lowland gorilla,Gorilla beringei graueri,and comparative mitochondrial genomics of theGorillaspecies.Mitochondrial DNA(doi:10.3109/19401736.2014.953103)
50Xiao-di Hu, Kui Li,Gao L. Z.*2014. The complete mitochondrial genome of celebes wild boar,Sus celebensis(Cetartiodactyla: Suina: Suidae) and comparative mitochondrial genomics of theSusspecies.Mitochondrial DNA(doi:10.3109/19401736.2014.953099)
49Xiao-di Hu,Gao L. Z.*2014. The complete mitochondrial genome of domestic sheep,Ovis aries.Mitochondrial DNA(doi:10.3109/19401736.2014.953076)
48Cheng-wen Gao, Shuo Wang,Gao L. Z.*.2013. Complete mitochondrial genome of the black flying fox,Pteropus alecto(Chiroptera: Megachiroptera:Pteropodidae).Mitochondrial DNA(doi: 10.3109/19401736.2013.869691)
47Jian-Jun Jiang, En-Hua Xia, Cheng-Wen Gao,Gao L. Z.*.2013.The complete mitochondrial genome of the western painted turtle,Chrysemys picta bellii(Chrysemys, Emydidae).Mitochondrial DNA(doi:10.3109/19401736.2013.873900)
46Xin-chun Mo, Ju Gao,Gao L. Z.*. 2013.Characterization of microsatellite markers and their application to genetic diversity analysis ofBrachypodium sylvaticumvar.breviglumefrom Yunnan, China.American Journal of Plant Sciences4 (7):1427-1434.
45Shuo Wang, Chao Shi,Gao L. Z.*2013. Plastid genome sequence of a wild woody oil species,Prinsepia utilis, provides insights into evolutionary and mutational patterns of Rosaceae chloroplast genomes.PLoS ONE8(9):e73946. doi: 10.1371/journal.pone.0073946.
44Yan Tong, Chun-Yan Wu,Gao L. Z.*2013. Characterization of chloroplast microsatellite loci from whole chloroplast genome ofCamellia taliensisand their utilization for evaluating genetic diversity ofC. reticulata(Theaceae).Biochemical Systematics and Ecology50: 207–211
43Jing Wu, Xiu-ying Kong, Chao Shi, Cui-yun jin,Gao L. Z.*, Ji-zeng Jia*. 2013. Dynamic evolution ofRht1homologous regions in grass genomes.PLoS ONE8(9):e75544. doi: 10.1371/journal.pone.0075544
42Hui Huang, Yan Tong, Qun-jie Zhang,Gao L.Z.*.2013. Genome size variation among and withinCamelliaspecies by using flow cytometric analysis and high-throughout genome sequencing.PLoS ONE8(5): e64981. doi:10.1371/journal.pone.0064981
41Chao Shi, Yuan Liu, Hui Huang, En-Hua Xia, Hai-Bin Zhang,Gao L.Z.*.2013.Contradiction between plastid gene transcription and function due to complex posttranscriptional splicing: an exemplary study ofycf15function and evolution in angiosperms.PLoS ONE8(3): e59620. doi:10.1371/journal.pone.0059620
40Zhu T, Xu PZ, Liu JP, Peng S, Mo XC,Gao L. Z.*. 2013.Phylogenetic relationships and genome divergence among AA- genome species of the genusOryzaas revealed by 53 nuclear genes and 16 intergenic regions.Molecular Phylogenetics and Evolution70:348–361
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38Shi C, Hu N, Huang H, Gao J, Zhao Y-J,Gao L. Z.*.2012.An improved chloroplast DNA extraction procedure for whole plastid genome sequencing.PLoS ONE7(2):e31468.doi:10.1371/journal.pone.0031468
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35Zhang Y, Jiang W-k,Gao L. Z.*.2011.Evolution of microRNA genes inOryza sativaandArabidopsis thaliana: an update of the inverted duplication model.PLoS ONE6(12):e28073.doi:10.1371/journal.pone.0028073
34Ji, P. Z., Li, H.,Gao, L. Z., Zhang, J., Cheng, Z. Q., Huang, X. Q. 2011. ISSR diversity and genetic differentiation of ancient tea (Camellia sinensisvar.assamica) plantations from China: implications for precious tea germplasm conservation.Pakistan Journal of Botany43(1): 281-291
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32Li Xiao-xiang,Liu Yong,Duan Yong-hong,Wang Shu-hong,Zhan Qing-cai,Sun Gui-hua,Gao L. Z. 2010. Estimation of mating system in naturalOryza rufipogonpopulations by SSR markers.Chinese Journal of Rice Science24(6): 601-607
31Yang Liu, Shi-xiong Yang,Gao L. Z.*. 2010. Comparative study on the chloroplastRPL32-TRNLnucleotide variation within and genetic differentiation among ancient tea plantations ofCamellia sinensisvar.assamicaandC. taliensis(Theaceae) from Yunnan, China.Plant Diversity32(5): 427-434
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29 Gao L. Z.*, Hongyan Xu.2008. Patterns of mutation rate variation at microsatellites: evolutionary insights from comparisons of Asian cultivated rice (Oryza sativaL.) and related species.BMC Evolutionary Biology8:11doi: 10.1186/1471-2148-8-11
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九、本领域的重要学术活动与社会活动
任BMC Evolutionary Biology（2010－2020）、BMC Evolution and Ecology（2020－）、Tropical Plant Biology（2020－）、Forestry Research（2020－）、Mitochondrial DNA Part B（2021－）和Tropical Plants（2022－）的副主编；任American Journal of Plant Sciences（2010－ ），Frontiers in Plant Science, Genetics and Genomics Section（2010－ ）、International Journal of Genomics and Proteomics（2010－ ）、Horticultural Research（2019－ ）、Horticulturae(2021－)、《中国科学数据》（2012－）和Horticultural Plant Journal（2021－）等刊物的编委；任中国科学院昆明植物研究所学术委员会委员（2009-2014）；任中国科学院热带植物可持续利用重点实验室学术委员会委员（2013 -2018）；任中国茶叶标准委员会委员（2012-2017）；任全国人才联盟农业专业委员会委员（2019.10-今）；任中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员（2021.5-今）；任中国生物工程学会生物资源专业委员会副主任委员（2017.9-今）；任中国生物信息学会多组学与整合生物学专业委员会委员（2022.5-今）；任云南省植物学会理事（2012-2020）；任云南省遗传学会理事（2012-2020）；任科技部973项目、国家重点研发计划、国家科技奖、国家外专局、国家自然科学基金委和其它国家（瑞典、法国等）基金委、教育部等评审专家；作为咨询专家参与生态环境部、质检总局和林业局等部委的项目规划；任中国科学院、云南省科技厅等评审与咨询专家；中国科学院战略研究系列报告《创新2050：科学技术与中国的未来》专家组成员，完成了“2050生物质资源科技领域发展路线图战略研究报告”中的“生物质能源植物基因资源与基因组学”的编研; 2011年6月作为中国代表团成员赴加拿大蒙特利尔市完成了《生物多样性国际公约名古屋议定书》的国际谈判。
海南大学
