本站讯（记者 董澄和）近日，海南大学三亚南繁研究院、热带作物学院夏志强研究员团队在Cell Press合作期刊The Innovation第三卷第四期发表题为“Hyper-seq：A novel, effective and flexible marker-assisted selection and genotyping approach”的研究论文，开发了一种低成本、高效、灵活、高通量的DNA测序文库制备和基因分型方法Hyper-seq，大大降低了建库测序的时间和价格成本。
Hyper-seq方法及其应用领域
粮食安全事关人类生存，其中种子是国家粮食安全的关键。近十年来，基因组辅助育种利用SNP和InDel标记，在分子标记辅助育种和品种培育方面发挥了重要作用。然而对于具有较大基因组的群体，全基因组测序仍然非常昂贵。为促进作物遗传改良，迫切需要低成本、自动化、能根据不同项目需求灵活调节标记密度的高通量测序文库制备方法和操作便捷的测序分析平台。为降低测序成本，促进种业发展，该研究开发了一种具有高成本效益的全新DNA测序文库制备和基因分型方法Hyper-seq。为了检测该方法的有效性，研究团队对6个物种的2094份样品进行了建库测序及数据分析。
该研究提出了一种低成本、高效、灵活、高通量的全新DNA测序文库制备和基因分型方法Hyper-seq。此方法适用于任何物种，仅需一步PCR，即可同时完成简化基因组、添加接头序列及扩增基因组序列。根据具体需要，可使用不同的Hyper-seq引物对标记的密度进行微调。Hyper-seq技术可用于作物遗传背景筛选、遗传图谱构建、DNA指纹图谱构建（专利号：No.102543和No. 202010102817.5）、全基因组关联分析、目标关键基因或新候选基因定位、品种鉴定、基因组选择育种、分子水平检验检疫等领域，具有广阔的应用前景。随着DNA测序成本的进一步降低，以及简捷、快速基因分型平台的开发，Hyper-seq技术将使更多的全球非模式作物育种者受益。
夏志强，研究员，海南大学三亚南繁研究院“基因组与大数据育种”团队负责人，海南大学热带作物学院副院长、博士生导师。美国加州大学戴维斯分校访问学者，海南省南海青年名家。从事基因组测序，转录水平、高通量技术开发与大数据育种技术方法等研究。开发多组学平台，提供染色体层面上的复杂基因组、甲基化等大数据分析体系。发表世界首个木薯、百香果、象草等精细基因组图谱。针对极复杂基因组完成马铃薯同源四倍体单倍型。原创研发两代超低成本基因型分型技术和表观遗传分析技术。获授权国家发明专利4项，国际发明专利3项，发表SCI论文26篇。两项国家重点研发专题负责人，主持参加国家自然科学基金、地区重点基金等科研项目10余项。
（编辑：王一钦）
