团队名称：热带作物基因组大数据育种团队

团队负责人：

夏志强，硕士/博士研究生导师。美国加州大学戴维斯分校访问学者，海南省南海青年名家，中国民族医药协会黎医药分会理事，热区石漠化山地绿色高效农业科技新联盟理事，中国热带作物学会国际合作工作委员会委员，海南大学热带作物学院副院长，中国热带农业科学院热带生物组学大数据中心副主任。

近10年来一直从事基因组，重测序，转录组和高通量技术开发等研究，在生物信息学，分子育种技术方法领域广泛涉猎和较丰富的研究经验。建立了高通量多组学图谱和高性能生物信息技术为基础的技术平台。在热带生物组学大数据中心，执行开发了多维度组学创新平台，提供一个全新的在染色体层面上的基因组、甲基化、转录组的大数据分析体系。不断开发新的实验技术和大数据算法。原创研发两代超低成本基因型分型技术和表观遗传分析技术，现已成功用于约50个物种研究中，国家发明专利授权四项，国际发明专利授权3项。在The Innovation、 Plant Biotechnology Journal、Nucleic Acids Research、Horticulture Research、Biotechnol Biofuels、Molecular Ecology Resources、Nature、Nature Communications等SCI杂志发表具有影响力的学术论文，累积影响因子约200，其中第一作者或通讯作者23篇，累积影响因子约120。担任2项国家重点研发项目专题负责人，主持和参加国家自然科学基金、重点基金、科技部973项目、国家木薯产业体系等科研项目10余项。

团队研究方向：基因组与大数据育种

团队研究成果：

(一）授权专利

1) 测序引物组及基于PCR的全基因组测序方法 201910261027.9

2) 基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性（AFSM）201410154134.9

3) 一种全基因组高效基因区富集测序方法201611199575.6

4) Whole Genome High-Efficiency Gene Region Enriching and Sequencing Method20211052782021.81国际专利

5) A Simple, Cost-effective and Amplification-based Whole Genome Sequencing Approach2020/069792021.61国际专利

6) DNA指纹图谱的构建方法、构建装置及终端设备 202010102817.5

7) Method and apparatus for constructing DNA fingerprint, and terminal device 102543 2021-11-22

8) 一种胞嘧啶甲基化挖掘的方法 201611198974.0

（二）代表学术论文

1) Meiling Zou, Zhiqiang Xia*. Hyper-seq: novel effective, flexible and great potential marker-assisted selection and genotyping approach 2022 (The Innovation, 实时IF: 28)

2) Wang Fang#，Xia Zhiqiang#*，Zou Meiling#，Zhao Long，Jiang Sirong，Zhou Yun，Zhang Chenji，Ma Yongzhen; Bao Yuting，Sun Haihong，Wang Wenquan*; Wang Jian*. The autotetraploid potato genome provides insights into highly heterozygous species 2022（Plant Biotechnology Journal IF：13.263，一区）

3) Zhiqiang Xia, Dongmei Huang, Shengkui Zhang, Wenquan Wang, Funing Ma, Bin Wu, Yi Xu, Bingqiang Xu, Di Chen, Meiling Zou, Huanyu Xu, Xincheng Zhou, Rulin Zhan, Shun Song. Chromosome-Scale Genome Assembly Provides Insights into the Evolution and Flavor Synthesis of Passion Fruit (Passiflora edulis Sims) 2021（Horticulture Research, IF：7.291，一区）

4) Shengkui Zhang#, Zhiqiang Xia#, Wenqing Zhang, Can Li, Xiaohan Wang, Xianqin Lu, Xianyan Zhao, Haizhen Ma, Xincheng Zhou, Weixiong Zhang, Tingting Zhu, Pandao Liu, Guodao Liu, Hubiao Yang, Jacobo Arango, Michael Peters, Wenquan Wang, Tao Xia Chromosome-Scale Genome Assembly Provides Insights into Speciation of Allotetraploid and Massive Biomass Accumulation of Elephant Grass (Pennisetum purpureum Schum.) Molecular Ecology Resources 2022,1（SCI收录，IF： 8.678）

5) Kaixing Fang, Zhiqiang Xia, Hongjian Li, Xiaohui Jiang, Dandan Qin, Qiushuang Wang, Qing Wang, Chendong Pan, Bo Li and Hualing Wu, Genome-wide Association Analysis Identifies Molecular Markers Asociated with Tea Flavor-related Metabolites 2021（Horticulture Research, IF：7.291，一区）

6) Xia Z, Zou M, Zhang S, Feng B, Wang W. AFSM sequencing approach: a simple and rapid method for genome-wide SNP and methylation site discovery and genetic mapping. Scientific Reports, 2014, 4: 7300. （SCI收录，IF：5.578）

7) Gu J#, Xia Z#, Luo Y, Jiang X, Qian B, Xie H, Zhu J, Xiong L, Zhu J, Wang Z. Spliceosomal protein U1A is involved in alternative splicing and salt stress tolerance in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Res, 2018, 46(4):1777-1792.（SCI收录，IF：11.561）

获奖及荣誉称号：

1) 2015年海南省科技进步一等奖：木薯比较基因组及光合产物高效积累机理 2015-J-1-R-048

2) 2016-2017年度神农中华农业科技奖二等奖：木薯全基因组测序及育种基础 KJ2017-R2-012-03

3) 2016年世界块根块茎作物大会（World Congress On Root And Tuber Crops）大会Poster一等奖