《Gut Microbes》:海南大学生物技术团队
在结直肠癌预测研究取得新进展
2021年1月11日，海南大学食品科学与工程学院食品生物技术团队与江南大学食品生物技术团队合作，在中科院1区TOP期刊《Gut microbes》(IF 2019: 7.74)在线发表了题为“Establishing a novel colorectal cancer predictive model based on unique gut microbial single nucleotide variant markers”的研究论文，构建了基于肠道微生物单核苷酸变异层面的结直肠癌无创诊断模型。
结直肠癌是最常见的癌症之一，是仅次于肺癌的第二大癌症死亡原因。现代研究强调了肠道微生物组在结直肠癌发生发展中的重要性，由于肠道微生物菌株之间潜在的基因组差异，分析肠道微生物单核苷酸变异，或可作为一种生物标志物，为结直肠癌发病机制和早期无创诊断提供一个新的视角。
本研究通过分析奥地利、意大利和日本3个国家的结直肠癌研究数据，采用随机森林算法，识别并构建了基于肠道微生物单核苷酸变异层面的结直肠癌无创诊断模型。通过宏基因组测序分析研究，该模型在海南结直肠癌患者人群验证中具有较高的准确性。同时，通过和4种其他疾病（溃疡性结肠炎、克罗恩病、二型糖尿病和肝硬化）对比分析，准确甄别出结直肠癌患者特有的3个位于直肠真杆菌和普氏粪杆菌基因组中的单核苷酸变异。因此，肠道微生物基因组突变与结直肠癌存在相关性，或可用于结直肠癌无创诊断。
该论文是海南省食品营养与功能食品重点实验室和食品生物技术团队近期取得的系列成果之一。该文第一作者为海南大学食品科学与工程学院2019级硕士研究生马臣臣，通讯作者为海南大学张家超副教授，研究合作单位为江南大学翟齐啸研究团队。该研究得到海南省科技厅重点研发项目（No. ZDYF2019150）的资助。
原文链接：https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/19490976.2020.1869505
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