1989年，原海南大学设立计算机专科专业，隶属理工学院；

1993年，原华南热带作物学院（1998年更名为华南热带农业大学）设立计算机应用专科专业，隶属计算机中心；

1995年，原华南热带作物学院计算机应用专科专业，划转经贸与计算机学部；

1998年，原海南大学计算机专科专业，划转信息科学技术学院；

1999年，原海南大学和原华南热带农业大学计算机专科均升格为计算机科学与技术本科专业；

2007年，原华南热带农业大学与原海南大学合并组建新的海南大学，两个学校的计算机科学与技术专业全部并入新海南大学信息科学技术学院；

2011年，获得计算机科学与技术一级硕士学位授予权，目前是海南省唯一的计算机科学与技术一级学科硕士点。

2019年，因学院拆分，原信息科学与技术学院拆分为信息与通信工程学院和计算机与网络空间安全学院，计算机科学与技术专业划转计算机与网络空间安全学院；

2021年，海南大学成立计算机科学与技术学院。