教育经历
2017-04至2020-03,东京大学,博士(人工智能、计算生物学)
2010-09至2013-06,吉林大学,硕士
2006-09至2010-06,吉林大学,学士
工作经历
2022-03至今,海南大学,计算机科学与技术学院,副教授
2020-04至2022-03,电子科技大学,基础与前沿研究院,博士后
研究方向
人工智能、计算生物学、生物信息学(偏计算方向)
主要研究工作集中在开发和利用人工智能方法对于生物学、药学中的多个交叉前沿和热点问题进行探索
基本介绍
张子龙,博士,海南大学计算机科学与技术学院副教授,博/硕士生导师,海南省“南海新星”第一批人才计划入选者,海南省D类高层次人才。中国计算机学会(CCF)生物信息学专业委员会委员,中国生物工程学会计算生物学与生物信息学(NCCBB)专业委员会委员,生物信息学与智能信息处理学术会议(BIIP)专业委员会委员,中国国家自然科学基金委(NSFC)函评专家,吴文俊人工智能科学技术奖评审专家。
获得海南省自然科学奖三等奖一项(排名第一),主持国家级自然科学基金地区项目一项、国家级自然科学基金青年项目一项、博士后国际交流引进项目一项(已结题)、合作主持国家级自然科学基金面上项目一项,主持海南省自然科学基金面上项目一项。以第一或通讯作者在BMC Biology、Bioinformatics、International Journal of Biological Macromolecules、Briefings in Bioinformatics、IEEE BIBM等生物信息学顶级期刊或会议发表论文多篇。受邀担任Frontiers in Genetics、Machines等SCI期刊客座编辑,担任Nature Communications、Genome Biology、PLoS Computational Biology等著名SCI期刊审稿人。
指导本科生发表第一作者SCI或CCF论文:
1.Cuilin Xiao, Zheyu Zhou, Jiayi She, Jinfen Yin, Feifei Cui,Zilong Zhang*. PEL-PVP: Application of plant vacuolar protein discriminator based on PEFT ESM-2 and bilayer LSTM in an unbalanced dataset.International Journal of Biological Macromolecules2024; 277:134317. (中科院大类一区,影响因子7.7, TOP期刊,肖萃林同学为2022级本科生,软件工程专业)
2.Yazi Li, Xiaoman Wei, Qinglin Yang, An Xiong, Xingfeng Li, Quan Zou, Feifei Cui*, Zilong Zhang*. msBERT-Promoter: a multi-scale ensemble predictor based on BERT pre-trained model for the two-stage prediction of DNA promoters and their strengths.BMC Biology2024; 22(1):126.(中科院大类一区,TOP期刊,李亚子同学为2021级本科生,应用数学专业)
3.ZheyuZhou, Cuilin Xiao, Jinfen Yin, Hao Duan, Chunling Liu, Feifei Cui, Zilong Zhang*. PSAC-6mA: 6mA Site Identifier Using Self-Attention Capsule Network based on Sequence-Positioning.Computers in Biology and Medicine.(中科院小类一区,TOP期刊,周喆誉同学为2022级本科生,软件工程专业)
4.Yunyun Su,Shiyu Yan, Chen Cao, Feifei Cui,QuanZou*, Zilong Zhang*. Human-Spa: An Online Platform Based on Spatial Transcriptome Data for Diseases of Human Systems.In: 2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM); 2023. pp. 293-298.(CCF-B会议,苏云云同学为2019级本科生,已保研进本课题组)
5.Haoye Qiu, Donglai Wang, Xiaoyang Liu, Feifei Cui, Zilong Zhang*.FCLNCM: Feature-Weight and Cluster-Weight Learning in Neutrosophic c-Means Clustering for Biomedical Applications.(审稿中,裘昊晔同学为2021级本科生,软件工程专业)
6.Ziyi Wang,Aoyun Geng, Hao Duan, Feifei Cui,Quan Zou*,Zilong Zhang*. A Comprehensive Review of Approaches for Spatial Domain Recognition of Spatial Transcriptomes. (审稿中,王梓懿同学为2021级本科生,软件工程专业)
指导本科生大创项目
基于癌症基因表达数据的自适应加权中智C-均值聚类算法研究(项目负责人:裘昊晔)
基于Diffusion的高穿膜性环肽定向生成模型(项目负责人:周喆誉)
指导本科生竞赛
1.李亚子等同学参赛作品《大语言模型在DNA启动子识别和强度预测中的综合运用:基于两阶段微调和集成学习的可解释性方法研究》全国大学生统计建模比赛广东赛区一等奖
2.周喆誉等同学参赛作品《基于深度学习的生物序列预测平台》获得中国高校计算机大赛海南省赛一等奖
课程教学
算法设计与分析、机器学习、图论及其应用、Python语言程序设计基础
个人主页
http://www.bioai-lab.com/info/zhangzilong
Ø欢迎本科期间希望获得科研训练并取得科研成果的同学随时联系,一起学习、讨论、共同进步;
Ø欢迎感兴趣报考硕士、博士的同学随时联系(署名邮件必回复),优先考虑具有计算机、统计、数学等相关背景的同学;
Ø与日本东京大学、沙特阿卜杜拉国王科技大学、日本电器通信大学、电子科技大学等国内外科研院校具有良好合作关系,优秀者可推荐前往深造、访学。