生态学院位于海南省海口市海南大学海甸主校区。学院最早可追溯到成立于1958年的华南热带作物学院生态研究室。生态学专业在1990年获硕士学位授权点、2011年获博士学位授权点、2018年开始招收本科生、2019年设立生态学博士后科研流动站，已形成“本科-硕士-博士”一体化的完备人才培养体系。

学院面向中国特色自由贸易港和海南省建设“三区一中心”（国家生态文明试验区、全面深化改革开放试验区、国家重大战略服务保障区、国际旅游消费中心）等国家重大需求，立足海南省、中国热带以及环南海区域独特复杂的气候与地理环境及丰富的生物多样性与生物资源，坚持理论与应用并重，开展多层次交叉融合的综合性研究。目前，已在热带雨林、红树林、珊瑚礁等热带典型生态系统的生物多样性与生物资源、陆海统筹生态修复、全球气候变化与生态系统响应等方面开展了较为系统的研究，积极服务海南省和中国热带地区海岛生态安全、区域社会经济协调发展模式等的实践指导、模式推广和政策咨询，为国家南方生态屏障建设、南海及周边区域生态保护与高质量发展等提供理论支撑与技术保障。

现有专任教师57人，其中教授14人，副教授24人；有国家级人才3人，海南省领军人才6人、拔尖人才16人。95%以上专任教师具有博士学位，其中，20余名教师在海外知名高校获得博士学位或有至少一年的海外留学或工作经历。专任教师平均年龄约38岁，年龄结构合理、学缘结构丰富。

学院现有本科生401人，硕士研究生247人，博士研究生105人。拥有设施齐全的实验室近2000平方米和20多家校外实习实践基地，建有国家生态质量综合监测站（海南热带雨林站（森林））、中国科协海智计划海南（海南大学）工作基地等国家级科研平台，以及海南省热带生态环境修复工程研究中心、海南蓝碳产业技术创新研究院、海南省环南海陆域生物多样性国际联合研究中心、海南省邹乐明院士工作站、海南省李百炼院士工作站等省部级科教平台，目前承担国家自然科学基金、国家及省部级重大科研攻关项目等50余项。